Der Aufsichtsrat der apoBank überwacht die Geschäftsführung des Vorstands. Er besteht aus je zehn Vertretern der Arbeitnehmer und der Anteilseigner der Genossenschaft. Die Vertreter der Anteilseigner werden von der Vertreterversammlung gewählt.

Sven Franke (stv. Vorsitzender)	Marcus Bodden
Martina Burkard	Mechthild Coordt
Stephanie Drachsler	Günter Haardt
Lukas Kaster	Carsten Padrok
Christian Scherer	Dietke Schneider

Dr. med. dent. Karl-Georg Pochhammer (Vorsitzender)	Apotheker Fritz Becker
Dr. med. Andreas Gassen	Dr. med. Torsten Hemker
Gerhard Hofmann	WP Ulrich Pukropski
Apotheker Friedemann Schmidt	Dr. Thomas Siekmann
Dr. med. dent. Reinhard Urbach	Susanne Wegner